Jusqu’en 2010, la Société de géographie de Genève conservait elle-même ses archives, d’abord au Palais de l’Athénée, puis dans un local au sous-sol de l’Ecole des Eaux vives. En son temps, elle disposait d’un responsable chargé de la gestion des archives.
Cela explique que les éléments de l’ensemble reçu en 2010 au département des manuscrits de la bibliothèque de Genève aient été en partie répertoriés au sein d’un inventaire réalisé à la fin de la décennie 1970-1980.
Les ensembles les plus cohérents de cet inventaire (procès-verbaux du bureau, des assemblées, comptabilité…) ont été conservés presque tels qu’ils figuraient dans cet inventaire (à l’exception de quelques rares disparitions de documents et des adjonctions ultérieures).
Un certain nombre d'éléments, dont des tirés à part du "Globe" ou les numéros des "Matériaux pour l'étude des calamités", dont la Bilbiothèque de Genève conserve déjà une collection complète ont été retournés à la Société de géographie.
La société de géographie de Genève conserve toujours les documents postérieurs à 1990.